Кристаллохимия, как и любая другая научная дисциплина, располагает определенным набором понятий и определений. Наиболее крупные и общие понятия называются категориями. Химическая кристаллография передала кристаллохимии три крупнейших эмпирических обобщения, которые можно назвать категориями этой науки: морфотропию, полиморфизм, изоморфизм. Накопленный в 20-ом веке теоретический и экспериментальный материал позволил ввести новую категорию - структурную гомологию.