Воды, которые находятся в толще вечномерзлых пород и мало зависят от режима деятельного слоя
B случае утери связи вследствие промерзания межмерзлотные воды переходят в категорию внутримерзлотных вод. Пo происхождению, степени минерализации и температуры межмерзлотные воды делятся на две группы. Первая включает криогалинные воды, во вторую группу входят пластово-поровые и пластово-трещинные слабоминерализованные воды, образующиеся вследствие неполного многолетнего протаивания мёрзлой толщи и последующего частичного промерзания несквозного талика. Такие системы чередующихся в разрезе межмерзлотных вод и мёрзлых слоёв во времени термодинамически неустойчивы: линзы межмерзлотных вод или промерзают сверху, или протаивают подстилающий их мёрзлый слой. Известны устойчивые межмерзлотные воды. Иx питание происходит на междуречьях, разгрузка - в долинах. Межмерзлотные водоносные "тоннели" поддерживаются за счёт движения подземных вод; при прекращении питания и при похолоданиях они промерзают. Межмерзлотные воды обычно мало пригодны для практического использования вследствие ослабленного водообмена, малых запасов и часто застойного режима.